北京时间6月14日凌晨0时，2020欧洲杯C组首轮，奥地利在布加勒斯特3-1击败北马其顿。在这场比赛中，替补出场的阿瑙托维奇在第90分钟打进杀死比赛的进球，他成为首名在本届欧洲杯上出战并且取得进球的现役中超球员。

阿瑙托维奇是在第59分钟替补登场的，他换下了卡拉奇克。第64分钟阿瑙托维奇就险些为队友送上助攻，当时他在禁区左侧传中。格雷戈里奇抢点头球一蹭，皮球飞向大门远角，迪米特雷夫斯基飞身将球扑出。阿瑙托维奇和格雷戈里奇替补出场后，奥地利在进攻端表现十分活跃。

第78分钟，格雷戈里奇接到阿拉巴传中门前包抄破网。第90分钟，莱默尔脚后跟妙传。阿瑙托维奇切入禁区横向晃开门将将皮球送进空门，这个进球帮助奥地利最终3-1击败北马其顿拿到本届欧洲杯开门红。进球后的阿瑙托维奇情绪显得很激动，队长阿拉巴赶紧上前安抚他的情绪。

阿瑙托维奇时隔近2年后，再次为奥地利国家队取得进球，上一次是在2019年9月。阿瑙托维奇打进国家队第27球，在队史射手榜上升至第6，与沙尔并列。这也是阿瑙托维奇在正式大赛上首粒进球，他将自己的名字写入了历史。

阿瑙托维奇替补出场就有建树，他上一次进球是在中超赛场上，4月份上海海港6-1大胜天津津门虎，阿瑙托维奇31分钟完成帽子戏法。在上海海港踢的39场比赛，他打进了20球，效率很高。不过，因为种种原因。阿瑙托维奇已经非常接近离队，之前意大利媒体就透露，32岁的阿瑙托维奇将与意甲球队博洛尼亚签下3年合同，中超将失去又一名巨星。