中超第二阶段赛事采取赛会制两回合淘汰制，即第一阶段A组第一名对阵B组第四名。A组第二名对阵B组第三名，A组第三名对阵B第二名，A组第四名对阵B第一名。每轮都是两回合淘汰制，直至决出冠军。

目前第二阶段的比赛地点还未公布，不过根据媒体记者此前的消息。第二阶段争冠组和保级组的赛事很可能继续分别在苏州和大连赛区进行。